Al capdavant de cada biblioteca de centre hi ha un cap de biblioteca amb la categoria de cap de secció. A cada biblioteca s'hi vinculen, amb criteris territorials, alguns dels diferents centres, departaments, facultats, escoles universitàries, centres de recerca, serveis i centres d'estudis en què està estructurada la UIB. Els fons bibliogràfics i documentals adquirits per aquestes entitats s'adscriuen a alguna de les biblioteques de la UIB.

Les vinculacions de les biblioteques de centre són:

• Campus de la UIB 

  • Biblioteca Anselm Turmeda
  • Biblioteca Arxiduc Lluís Salvador
  • Biblioteca Gaspar Melchor de Jovellanos
  • Biblioteca Guillem Cifre de Colonya
  • Biblioteca Mateu Orfila i Rotger
  • Biblioteca Ramon Llull
  • Biblioteca Son Lledó

• Seus universitàries

  • Eivissa - Formentera
  • Menorca